・シリーズ初のオープニングムービー登場。 ・『お姉チャンバラ2』のセーブデータ（ステータス＆クエスト達成率）を引き継ぎ可能。
またメモリーカード内に『THE戦娘』のデータがあると、いきなり花と菊が使用可能になる。
（いずれも、CONTINUEでゲームを開始した場合に、引き継ぎが行われる。
花と菊の出現条件を満たしていない２のデータを引き継ぐと、戦娘のデータは
無視されてしまうというケースも時にあるようだ。要注意） ・"彩咲ペア" のほかに、 "双葉ペア"、 "戦娘ペア" のストーリーも用意されている。
メンバーをごちゃまぜにした場合、最初に選んだキャラが所属するペアのストーリーになる。
・最初と最後のステージ以外でも、冒頭で声優のナレーションが入る。
・ロード画面のゾンビが青色から緑色に。 ゲームオーバー画面で△を押すとヒント表示。
・ダメージを受け、ライフの青くなった（回復可能）部分が、ロード画面を挟んでも消えない。 ・効果音の変更。 彩のダガー、レイコや警官ゾンビのショットガンSEなど。
・暴走時、ボイスにエコーがかかるように。 キャラ放置時のボイスが追加。
・彩コス4（彩たん）の声優が変更され、ボイス一新。新声優が誰かは不明。 ・全体MAPに、次に向かうべき地点が★で表示されるように。 ・クリア済みの不浄門は、扉の周りに書かれたオレンジ色の文字が消滅する。
これによって中へ入らずとも、クリアの識別が可能に。 ・カメラ視点にズームが加わった。右スティック上下で ズームイン / ズームアウト。 ・中断セーブも可能に。QUIT GAMEを選ぶと、表示は出ないがオートセーブされる。
次回プレイ時にロード出来るが、選択しないとデータは強制的に消されてしまう。
（中断セーブをしたエリアに入った時点から再開可能。ただし、
経験値など一部の情報はリセットされる。無傷クエストには超便利な仕様ではある。） ・中断セーブデータをロードしなかった場合、アイテム取得状態は
最後にステージクリアしたときのものに戻る。
・ゲームバランスを改善。 EASY、VIOLENTの難度低化（ボスの大幅弱体化）。
COOLの判定甘く。 飛び道具の性能上昇。 クエスト条件変動、一部は判定甘く。
初代作ほどではないが、警官の弾を刀で弾きやすく。
イエローオーブの経験値上昇、画面に出現している時間も長く。
『血塊』の穢れ率が 1/2から1/3になり、回復力もDOWN。
『西館管理キー』の名前が『エスカレーターの鍵』に。 ライフ残量でアイテム出現率変化。 ・VIOLENTの仕様変更。
暴走時の体力減少速度がDOWNしたものの、レッドオーブの回復量も1目盛りにDOWN。
・ボスの攻撃パターンが一部追加。
・プレイヤーキャラ交代時、ボスが硬直してしまうバグを修正。 ・空振り時でも、それがCOOLだった場合は、新規のエフェクトが出る。 ・ロックオン（R1押し続け）中、一部の技がジャンプキャンセル不能化。
結果としてキャンセル回避アクションが容易に。
・双葉ペアのストーリーをプレイする場合、一部BGMが双葉理保の人気曲に変化する。 ステージ1, 4 ＝『 Misty you 』 作詞/作曲：momo 編曲：玉置泰宏
ステージ2, 3 ＝『 フローラのTea party (Trance Remix) 』 作詞/作曲：momo 編曲：渡辺浩
ステージ5, 6 ＝『 Dancing in the rain 』 作詞/作曲：momo 編曲：玉置泰宏
ステージ7 ＝『 Limit 』 作詞/作曲：momo なお、フローラのTea party (Trance Remix)はループ箇所に問題有り。『 Limit 』は新曲で、
未だにCD化されていないが、他三曲はアルバム『Feels Like First Time!!』に収録されている。 ・戦娘ペアのストーリーをプレイする場合、一部BGMが『THE戦娘』と同じものに変化する。
ステージ1, 4 ＝ 壱章, 弐章, 秘章のBGM
ステージ2, 3 ＝ 参章, 四章, 七章, 八章のBGM
ステージ5, 6 ＝ 九章, 終章のBGM
なんとボス戦、ラスボス戦まで『THE戦娘』のものになる。
主な作曲者は本作と変わらない。いずれも良曲だぞ。
・サバイバルステージのデザイン変更。
・プラクティスモードでは、COOLなどのタイミングを示す専用のバーが表示されるように。
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